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1.
Rev. biol. trop ; 61(2): 565-575, Jun. 2013. ilus, graf, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-675452

ABSTRACT

In Colombia, potato crops are affected by a wide variety of viruses such as PVY, PLRV, PVX, PMTV and PVS. Unfortunately, there are very few studies on the biology, distribution and pathogenicity of these viruses; this situation is even worse for the latent virus PVS. In this work, we evaluated the presence of PVS in four Colombian provinces (Antioquia, Boyacá, Cundinamarca, Nariño) by the use of ELISA. We also studied the degree of molecular variation by sequence comparison of a segment of the gene encoding for the viral coat protein. In average, PVS was detected in 40% of 320 analyzed samples of potato leaves; the highest levels were observed in the East of Antioquia (49%) and Pasto (Nariño) (47%), while in the other regions ranged between 35% and 42%. Analysis of sequence revealed the presence of two PVS strains in Colombia: three isolates were associated to PVS O (Ordinary) and twelve belonged to PVS A (Andean). A high diversity was observed among PVS A strains with percent identities in the range of 88-99%. These findings highlight the importance of strengthening seed certification programs and quarantine measures in Colombia for viruses like PVS, which can cause losses of up to 20% in potato crops and even higher in mixed virus infection.


El cultivo de papa en Colombia es afectado por diversos virus, que incluyen PVY, PLRV, PVX, PMTV y PVS; aunque se han realizado pocos estudios sobre la biología, distribución y patogenicidad de dichos virus en Colombia, siendo especialmente escasa la información referente al PVS. En este trabajo se evaluó mediante pruebas de ELISA, la presencia del PVS en cuatro departamentos de Colombia, así como sus niveles de variación, a partir de la secuenciación de una porción del gen de la cápside viral. Los resultados indicaron una detección promedio del virus en el 40% de las 320 muestras analizadas, con zonas como el Oriente cercano de Antioquia (49%) y Pasto (Nariño) (47%), donde se detectó en mayor proporción el virus. Los análisis de variación molecular indicaron la presencia de las dos razas de PVS (Ordinaria y Andina) en Colombia, siendo los aislamientos de PVS A los más diversos, al pre- sentar un rango de identidad del 88 al 99%. Estos hallazgos indican que es imperativo el fortalecimiento de los programas de certificación de semilla y vigilancia cuarentenaria en el país, especialmente para virus como el PVS, que aunque puede ser asintomático, causa pérdidas hasta del 20% en cultivos de papa.


Subject(s)
Carlavirus/genetics , Plant Diseases/virology , Solanum tuberosum/virology , Colombia , Carlavirus/classification , Carlavirus/isolation & purification , Enzyme-Linked Immunospot Assay , Genetic Variation
2.
Rev. colomb. biotecnol ; 13(1): 85-93, jul. 2011. tab, graf, ilus
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-600578

ABSTRACT

Los problemas virales reducen los rendimientos y la calidad del tubérculo semilla en cultivos de papa de todo el mundo. Esta investigación se planteó con el fin de evaluar los niveles de incidencia de potyvirus en diez de las principales regiones cultivadoras de papa de los departamentos de Antioquia, Boyacá, Cundinamarca y Nariño (Colombia), y las características genotípicas del virus Y de la papa (Potato virus Y, PVY), seleccionado por ser el potyvirus más limitante de este cultivo. Para la evaluación de la incidencia se utilizaron pruebas de Elisa con anticuerpos que reconocen epítopes comunes a los potyvirus, mientras que las pruebas moleculares incluyeron el análisis filogenético de secuencias parciales del gen de la cápside viral de 33 aislamientos, así como la secuenciación de una porción de los extremos 5´ y 3´del genoma de dos cepas colombianas de este virus. Los resultados confirmaron la presencia de potyvirus en los cultivos de los cuatro departamentos evaluados, con una incidencia promedio del 72%, siendo este nivel superior al 56% en todas las zonas evaluadas. Los análisis moleculares del PVY, permitieron asociar las cepas colombianas estudiadas con las razas PVYN y la variante PVYNTN, esta última responsable de la enfermedad conocida en el mundo como PTNRD (Potato tuber necrotic ringspot disease).


Potato viruses are responsible for significant reductions in seed quality and crop yields around the world. In this study, we evaluate the levels of incidence of potyvirus in ten potato growing regions of Colombia from the provinces of Antioquia, Boyacá, Cundinamarca and Nariño. As PVY is the most limiting potyvirus in potato farming, a molecular characterization of Colombian PVY strains was also performed. Incidence was evaluated by ELISA using general potyvirus antibodies. Phylogenetic analysis were made on the partial sequence of the capsid gene from 33 isolates. A portion of the 5´ and 3' genome ends was obtained from two Colombian strains. Results confirmed the presence of potyvirus in the four provinces with an average incidence of 72%. The lowest incidence value was 56%. Molecular analysis clustered all Colombian isolates with strains PVYN and PVYNTN, the latter responsible for the disease known as PTNRD (Potato tuber necrotic ringspot disease).


Subject(s)
Potyvirus/isolation & purification , Potyvirus/enzymology , Potyvirus/physiology , Potyvirus/genetics , Potyvirus/immunology , Potyvirus/metabolism , Potyvirus/pathogenicity , Potyvirus/chemistry , Potyvirus/ultrastructure , Capsid/physiology , Capsid/immunology , Capsid/microbiology , Capsid/parasitology , Capsid/pathology , Capsid/chemistry
3.
Dermatol. argent ; 15(5): 334-339, 2009. ilus, tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-719839

ABSTRACT

Antecedentes. En el modelo murino más estudiado, producido por L, major, se observa correlación entre cepas resistentes (C57BL6) y susceptibles (BALB/c), con respuestas inmunes Th1 o Th2, respectivamente. Esta dicotomía no se observa en modelos desarrollados con otras especies de Leishmania (L). Por ello es importante avanzar en el estudio de modelos experimentales con especies predominantes de nuestra zona. El objetivo fue reproducir la enfermedad en diferentes cepas murinas luego de la infección por L. amazonensis. Métodos. Para conocer el efecto de la variable cepa de ratones sobre la susceptibilidad a la infección por L. amazonensis, se aplicó un inóculo constante del parásito a las cepas en estudio. Se evaluó la respuesta de las cepas C57BL/6, BALB/c y Swiss, por medición de lesiones, estimación de carga parasitaria e histopatología. Por ELISA se determinaron anticuerpos y citoquinas en suero. Test estadístico: análisis de la varianza (ANOVA). Resultados. BALB/c demostró máxima susceptibilidad a la infección; Swiss presentó un fenotipo intermedio, y C57BL/6 fue la menos susceptible. Se obtuvieron modelos murinos que reprodujeron distintas formas clínicas comparables a la enfermedad humana. Conclusiones. Los resultados servirán para extrapolar a la patología humana las conclusiones de posteriores ensayos terapéuticos y profilácticos sobre animales experimentales.


Background.Most studies have been based onL. majormouse mo-dels, where Th1 and Th2 immune responses are associated with resistant(C57BL/6) and susceptible (BALB/c) strains, respectively. This dichotomyis not generally observed in models developed with otherLeishmania (L.)species. Therefore, the study of mouse models involving species respon-sible for human infections in our region represents an important challen-ge. The aim was to induce the disease in diff erent mouse strains after theinfection withL. amazonensis.Methods.To study the eff ect of “mice strain” variable over “susceptibilityforL. amazonensisinfection”, a constant parasite inoculum was appliedto the studied mice strains. Response to infection was characterized inC57BL/6, BALB/c, and Swiss strains by lesion measurement, parasitic loadestimate and histological analysis. Serum presence of antibodies andcytokines was determinated by ELISA. Statistical analysis: ANOVA test.Results.BALB/c showed the maximum level of susceptibility towardsthe infection. Swiss demonstrated an intermediate phenotype andC57BL/6 was the most resistant strain. We could obtain murine modelsrefl ecting diff erent clinical forms present in human disease.Conclusions.These results will be useful to extrapolate to human pa-thology future conclusions about therapeutic and prophylaxis analysison experimental models (Dermatol Argent 2009;15(5):334-339)


Subject(s)
Leishmania , Leishmaniasis, Cutaneous , Mice , Models, Animal , Skin/immunology , Skin/parasitology , Skin/pathology
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